实际上，自闭症儿童的攻击行为（自伤与伤人）或不适当行为都是属于沟通缺陷的替代表达方式。
解决思路是透过行为分析了解其行为的功能性目的，然后教导以合适的行为（功能性等值的行为）以替代不合宜的行为，适当的行为逐渐养成后，不适当的行为会自然消失，或教以正确的沟通方式（称之为功能性沟通训练）以表达其基本需求。
有研究认为自闭症儿童的许多问题行为是用来传达某种信息，如「我不知道怎么做」「我想要坐在我的座位上」「我现在要玩具」等等。
简单的阻止这些问题行为等于阻止他们的沟通行为，并不能取得良好效果，也许这种问题行为没有了，又会出来其他的问题行为，而如果可以找到合适的替代方式，孩子的问题行为就会明显得到控制。
比如，当自闭症儿童能充分使用语言表达需求（功能性沟通训练）时，（如：「我不要喝水」，「我不想搭电梯」等等），其不适当的行为便消失了。
常见自闭症儿童在别人游戏时打人，这不表示他要攻击别人，而是想要参与游戏。
又比如有些自闭症儿童会有撞头的行为，这种行为常常发生在他们生气的时候，如要吃面包被阻止时，或正在睡觉却被叫醒做功课时，而若此行为发生在被要求的时候，则可能是他们抗议或拒绝的表示，教导他们用合适的方式表示：「我生气了」「我不要」「我不喜欢」等等，往往可以起到很好的效果。
