在自闭症ABA训练中，我们常会使用到惩罚。
惩罚就是当一种不良行为出现时，立刻给予厌恶刺激（惩罚物）或剥夺正在享受的正强化物（奖励物）。正确使用惩罚策略，会逐渐减少不良行为。在自闭症儿童行为矫正训练过程中，可以用的惩罚方法包括身体限制、隔离和遺责。
惩罚对自闭症儿童行为的界定及惩罚方法的选择都十分重要。惩罚只能部分地减少或暂时抑制不良行为，惩罚本身有许多副作用和弊病，因此要慎用。惩罚法必须在正强化无效果的前提下，不得已时才使用。
在自闭症ABA训练中，使用惩罚时要注意以下几点：
1、惩罚要及时准确
惩罚的实施必须及时，尤其对理解能力差的自闭症儿童，必须抓住当时的情境（如夺球时咬别人的手）及时给予适当的惩罚（遺责加身体限制）。要分清孩子哪些行为是一定要惩罚的，如打人、咬人、严重破坏行为、令人讨厌的行为；哪些只属于认知障碍引发的一般性不良行为，则不必过多责备，教给他怎么做就行。
2、遺责的同时身体限制也要跟上
当自闭症儿童出现攻击他人或自伤、破坏财物的行为时，家长往往会遺责孩子，但同时还应该限制孩子的身体动作，单一的遺责将失去惩罚的作用。比如，孩子狠很抓了他人的头发，除了先说“放下手”之外，还要用力将他的手往下按（身体限制）。
3、选择好惩罚物
自闭症儿童对惩罚物的厌恶程度存在个体差异，因此对惩罚物的强度反应不ー样。比如，对一个只要成人表情严肃大声斥责就不敢再继续去破坏玩具的孩子，就不必取身体限制一类的惩罚手段。反之，对于被遺责根本不害怕的孩子，就必须采取责备加厌恶刺激的手段才能制止他的不良行为。
惩罚应和替代行为的强化相结合。如果不得已使用了惩罚时，就要找出一种与不良行为相抵消的良好行为。比如，一个爱在水泥地上打滚或撞头的自闭症儿童，家长或教师除了给予他必要的惩罚（身体限制）外，还要设法强化他坐在沙发或椅子上玩玩具、做游戏、听音乐的良好行为。
